Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPAG4Q9NPE6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms