Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms