Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms