Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPJQ9HC77 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms