Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms