Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms