Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms