Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms