Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM175Q9BSA9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms