Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms