Protein–RNA interactions for Protein: Q99759

MAP3K3, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K3Q99759 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP3K3Q99759 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP3K3Q99759 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms