Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms