Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBS4Q96RK4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms