Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85AQ96PX6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms