Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms