Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP13Q92995 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP13Q92995 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP13Q92995 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP13Q92995 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms