Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms