Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCOLN3Q8TDD5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms