Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH3Q8TBE1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms