Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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