Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms