Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDSS2Q86YH6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms