Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms