Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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