Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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MED27Q6P2C8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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MED27Q6P2C8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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