Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIF1Q5UIP0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms