Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms