Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms