Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms