Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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