Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMG9

TMEM52B, Transmembrane protein 52B, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM52BQ4KMG9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM52BQ4KMG9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM52BQ4KMG9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms