Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 VTI1BP2-201ENST00000394154 696 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 TAC3-205ENST00000415231 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms