Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms