Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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