Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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