Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A3Q16572 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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