Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ZFHX3Q15911 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ZFHX3Q15911 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ZFHX3Q15911 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ZFHX3Q15911 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ZFHX3Q15911 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ZFHX3Q15911 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ZFHX3Q15911 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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