Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms