Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms