Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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