Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms