Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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CHD4Q14839 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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CHD4Q14839 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CHD4Q14839 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CHD4Q14839 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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CHD4Q14839 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
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