Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SSPNQ14714 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSPNQ14714 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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