Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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