Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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DDX39BQ13838 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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