Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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