Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PWP1Q13610 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms