Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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