Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms