Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PTPRSQ13332 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PTPRSQ13332 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PTPRSQ13332 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPRSQ13332 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PTPRSQ13332 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PTPRSQ13332 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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PTPRSQ13332 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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